java 抓取windows进程，并发送参数给进程

我写了段程序，用Process 获得Runtime.getRuntime().exec（）返回的进程。
我有一句代码是操作com，然后会对一个进程操作，这个进程会在服务器上弹出个提示框，并要人工点下是或否。
我想实现的是在这个框弹出来后，自动对他赋值，不用人工操作。
实现办法：首先抓取这个进程，这里就不会了，我是这样想的，用try(操作com)catch(这个进程弹出框){对这进程赋值}，最后关闭这个进程。
求教具体代码该如何实现，或者我的想法根本不对，catch除了抓取异常，还能抓取进程吗？即便抓取到了，对进程赋值了，也无法完成try里面的语句了，如果在finally里再写一遍操作com，还是会出现警告框。
求思路，求代码。

补充：Java ,  Web 开发