swing做的软件中，持久化层数据库一般怎么进行管理？

最近要做一个项目，里面包含许多业务逻辑，界面已经画好了，但是在做业务逻辑处理的时候发现了很多问题，由于之前是做J2EE的，所以习惯性的就想在软件中加入dao，但是没有了框架对事物进行管理，线程什么的弄得头都大了，在正常的项目中，数据库这边大神们是怎么处理的啊？
是使用工具类对jdbc进行封装后再使用还是直接使用jdbc手动处理
求大神指教 --------------------编程问答-------------------- 三层结构中应用到后台也不错的啊。
建议对jdbc使用封装处理，毕竟这是java的特性，还是蛮好用的。
当然如果就一次两次的话就算了。
我觉得这个和j2ee数据库都是一样的啊。

--------------------编程问答-------------------- JPA，Guice http://code.google.com/p/google-guice/wiki/GuicePersist --------------------编程问答-------------------- 持久化层跟web没有什么不同。 --------------------编程问答-------------------- j2ee不止是web开发，楼主。。需要多了解基础了 --------------------编程问答-------------------- 建议封装。和j2ee使用是一样的。

补充：Java ,  Java SE