poj 2778 DNA Sequence AC自动机+矩阵快速冥
题意很简单,假定文本集就是A,C,T,G,给定M个模式串,问你长度为N的文本不出现这些模式
串的可能性到底有多少种。。。
确实非常不直观的样子。。。
解法是先学学AC自动机,建立起Trie图,根据trie图可以得到长度为1的路径矩阵,然后再快速
冥得到长度为N的路径矩阵。
说起来都非常纠结,没学过AC自动机更加无法理解。学AC自动机之前据说得先学Trie树和KMP
才好理解。学AC自动机搞Trie图就花费了近2天了,然后弄懂这个题又是一天,好在基本明白了。
马上快比赛了,从长春换到金华也不知道是好是坏。。。还是弱菜啊。。。
贴下我的Trie图+快速冥(直接二分了,没有写成数论里面那种算法)...
#include <stdio.h>
#include <string.h>
#include <algorithm>
#include <queue>
using namespace std;
typedef long long INT;
const int MOD = 100000;
const int MAX_P = 100;
const int MAX_D = 4;
int nIdx[256];
char szPat[MAX_P];
INT nMatrix[MAX_P][MAX_P];
INT B[MAX_P][MAX_P];
INT A[MAX_P][MAX_P];
void InitIdx()
{
nIdx['A'] = 0;
nIdx['C'] = 1;
nIdx['T'] = 2;
nIdx['G'] = 3;
}
struct Trie
{
Trie* fail;
Trie* next[MAX_D];
int no;
bool flag;
Trie()
{
fail = NULL;
memset(next, 0, sizeof(next));
no = 0;
flag = false;
}
};
Trie tries[MAX_D * MAX_P];
int nP;
Trie* pRoot;
Trie* NewNode()
{
memset(&tries[nP], 0, sizeof(Trie));
tries[nP].no = nP;
return &tries[nP++];
}
void InitTrie(Trie*& pRoot)
{
nP = 0;
pRoot = NewNode();
}
void Insert(char* pszPat)
{
Trie* pNode = pRoot;
while (*pszPat)
{
if (pNode->next[nIdx[*pszPat]] == NULL)
{
pNode->next[nIdx[*pszPat]] = NewNode();
}
pNode = pNode->next[nIdx[*pszPat]];
++pszPat;
}
pNode->flag = true;
}
int BuildAC(Trie* pRoot)
{
memset(nMatrix, 0, sizeof(nMatrix));
pRoot->fail = NULL;
queue<Trie*> qt;
qt.push(pRoot);
while (!qt.empty())
{
Trie* front = qt.front();
qt.pop();
for (int i = 0; i < MAX_D; ++i)
{
if (front->next[i])
{
Trie* pNode = front->fail;
while (pNode && pNode->next[i] == NULL)
{
pNode = pNode->fail;
}
front->next[i]->fail = pNode? pNode->next[i] : pRoot;
if (front->next[i]->fail->flag == true)
{
front->next[i]->flag = true;
}
qt.push(front->next[i]);
}
else
{
front->next[i] = front == pRoot? pRoot : front->fail->next[i];
}
if (front->next[i]->flag == false)
{
nMatrix[front->no][front->next[i]->no]++;
}
}
}
return nP;//节点总个数
}
void MultyMatrix(INT A[][MAX_P], INT B[][MAX_P], INT C[][MAX_P], int nSize)
{
for (int i = 0; i < nSize; ++i)
{
for (int j = 0; j < nSize; ++j)
{
INT nSum = 0;
for (int k = 0; k < nSize; ++k)
{
nSum = (nSum + A[i][k] * B[k][j]) % MOD;
}
C[i][j] = nSum;
}
}
}
void CopyMatrix(INT A[][MAX_P], INT B[][MAX_P], int nSize)
{
for (int i = 0; i < nSize; ++i)
{
for (int j = 0; j < nSize; ++j)
{
A[i][j] = B[i][j];
}
}
}
void MatrixPower(INT M[][MAX_P], int nSize, INT nP)
{
if (nP == 1)
{
&nbs
补充:软件开发 , C++ ,